La dinámica del juego es sencilla: ir avanzando a través de las distintas fases, las cuales consistirán básicamente en darle caña a cuanto enemigo aparezca delante nuestra en escenarios en 3-D, y conforme se complica la historia, ir reclutando nuevos mutantes para la causa. Hasta 15 personajes serán manejables, siempre seleccionándolos como mucho de 4 a la vez, y tendremos que hacer uso de sus diferentes habilidades, tanto individuales como combinadas, para superar todos los obstáculos que se nos presenten.


Conforme vayamos superando las fases - cuya longitud varía entre los pocos minutos y el par de horas - los personajes irán ganando puntos de experiencia, los cuales obtendremos según una calificación al completar las misiones, principalmente dependiendo de los enemigos que neutralicemos. Estos puntos, aunque los gane uno de los cuatro miembros del equipo que controlemos en ese momento, pueden utilizarse por cualquiera de los X-Men disponibles en ese momento, y a través de un sencillo menú podremos invertir esos puntos en mejorar cualquiera de las características de los personajes, así como en sus diferentes poderes.




Entre fase y fase, y controlando a la joven Magma, tendremos la ocasión de visitar todos los rincones del Instituto Xavier para Jóvenes Talentos, donde podrás hablar con cualquiera de los mutantes que te encuentres (y acceder a misiones antiguas a modo de flashbacks), acceder a montón de extras, como los diseños empleados para el juego (conceptualmente muy similares a la línea Ultimate de Marvel), así como entrenar en la famosa Sala de Peligro de los X-Men, lo que te permitirá ganar puntos de experiencia que te harán falta para avanzar en las misiones, cuya dificultad aumenta considerablemente conforme avanzamos en la historia.